Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Fam160a1-202ENSMUST00000118408 4445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Slc5a6-201ENSMUST00000080431 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm7769-201ENSMUST00000212900 933 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Nedd4l-204ENSMUST00000224347 3150 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Nup155-201ENSMUST00000163765 6402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ccdc18Q640L5 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
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