Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm28175-202ENSMUST00000209336 1477 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Gjb2Q00977 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms