Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Chd1P40201 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Cdk20-201ENSMUST00000021939 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Arfgef2-201ENSMUST00000099078 8770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Umodl1-201ENSMUST00000066554 5007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Chd1P40201 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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