Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Tmed5-201ENSMUST00000002837 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm5386-201ENSMUST00000121749 2450 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Sdad1-203ENSMUST00000201143 2156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC130219.1-201ENSMUST00000228406 3433 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Myo7b-201ENSMUST00000134663 6621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprkP35822 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms