Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr976-203ENSMUST00000217360 1164 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tcf4-206ENSMUST00000114982 3694 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC160637.1-201ENSMUST00000214037 3887 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zfp180-202ENSMUST00000203854 3845 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 B020014A21Rik-201ENSMUST00000217333 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Egf-209ENSMUST00000199615 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm8065-201ENSMUST00000164048 605 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm42959-201ENSMUST00000202184 212 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213 ms