Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC122346.1-202ENSMUST00000225586 2116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Psg19-201ENSMUST00000004657 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SftpcP21841 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms