Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 4930467D21Rik-202ENSMUST00000181724 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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H2-Eb1P04230 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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H2-Eb1P04230 Gm29364-201ENSMUST00000185289 2167 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
H2-Eb1P04230 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
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H2-Eb1P04230 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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H2-Eb1P04230 Gm16248-201ENSMUST00000124238 243 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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H2-Eb1P04230 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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H2-Eb1P04230 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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H2-Eb1P04230 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
H2-Eb1P04230 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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