Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Tgtp1-201ENSMUST00000068063 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm3326-201ENSMUST00000164656 1043 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm37369-201ENSMUST00000194179 615 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 4933406L23Rik-201ENSMUST00000203567 1509 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ifnb1P01575 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ifnb1P01575 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms