Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Cldn34c3J3QJW5 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms