Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Sox5-214ENSMUST00000170367 7184 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pdpk1Q9Z2A0 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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