Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm8976-201ENSMUST00000187136 703 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm43709-201ENSMUST00000199870 559 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm30270-201ENSMUST00000202675 524 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 AC163354.1-202ENSMUST00000221460 656 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr543-201ENSMUST00000061482 1130 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Trim39Q9ESN2 Olfr1320-202ENSMUST00000214273 1982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm46992-201ENSMUST00000222120 1389 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Txndc16-204ENSMUST00000128484 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf19-201ENSMUST00000111234 4051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Lrrc28-201ENSMUST00000032775 1817 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Dlg2-203ENSMUST00000107193 4910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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Trim39Q9ESN2 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm13633-201ENSMUST00000120668 898 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm17053-201ENSMUST00000163501 495 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm27283-201ENSMUST00000184853 323 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm28478-201ENSMUST00000185802 183 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm42628-201ENSMUST00000198498 764 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Olfr326-ps1-201ENSMUST00000204790 392 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Trim39Q9ESN2 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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