Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Gm6368-201ENSMUST00000119727 2147 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PtprtQ99M80 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Acpp-202ENSMUST00000112590 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PtprtQ99M80 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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