Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Csmd1Q923L3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Coro7-201ENSMUST00000038552 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm29226-201ENSMUST00000186871 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Enpp4-202ENSMUST00000143137 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm21152-201ENSMUST00000190271 3483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm42881-201ENSMUST00000198636 3344 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Snhg11-201ENSMUST00000109488 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Csmd1Q923L3 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms