Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Myt1-203ENSMUST00000108757 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Mcm10-201ENSMUST00000027980 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Ccdc88cQ6VGS5 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9871-203ENSMUST00000204837 1560 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Ccdc88cQ6VGS5 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ccdc88cQ6VGS5 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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