Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Cd68-201ENSMUST00000018918 1230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Cep57l1-205ENSMUST00000187143 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Ccdc18Q640L5 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ccdc18Q640L5 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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