Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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Hoxa13Q62424 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
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Hoxa13Q62424 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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Hoxa13Q62424 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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Hoxa13Q62424 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Hoxa13Q62424 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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Hoxa13Q62424 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
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Hoxa13Q62424 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Abcc12-203ENSMUST00000131423 4893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Hoxa13Q62424 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms