Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ttc21bQ0HA38 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc21bQ0HA38 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc21bQ0HA38 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ttc21bQ0HA38 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc21bQ0HA38 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc21bQ0HA38 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc21bQ0HA38 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Ttc21bQ0HA38 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ttc21bQ0HA38 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms