Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Vmn1r42-201ENSMUST00000089419 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NficP70255 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Mthfr-ps1-201ENSMUST00000174153 601 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NficP70255 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
NficP70255 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NficP70255 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NficP70255 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms