Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
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Hoxd9P28357 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm8540-201ENSMUST00000168952 732 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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