Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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TtrP07309 Olfr214-202ENSMUST00000203867 1255 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TtrP07309 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TtrP07309 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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