Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 4933402E13Rik-201ENSMUST00000051414 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm6706-201ENSMUST00000145087 318 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Mir5623-201ENSMUST00000176631 70 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
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Rabgef1Q9JM13 Lrrc9-203ENSMUST00000161284 3817 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Strbp-202ENSMUST00000072186 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm6275-201ENSMUST00000118971 1122 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm11954-201ENSMUST00000121403 349 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm11897-201ENSMUST00000121976 828 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Gm11534-202ENSMUST00000129261 470 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Rabgef1Q9JM13 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
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