Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Drp2-206ENSMUST00000153424 7135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ercc6l2Q9JIM3 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms