Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Clasp1-220ENSMUST00000191445 4914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Adamtsl1-203ENSMUST00000107178 7839 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Lyrm1-205ENSMUST00000207270 5845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Usp54Q8BL06 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Kyat3-201ENSMUST00000044392 4206 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp54Q8BL06 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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