Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NischQ80TM9 Topaz1-201ENSMUST00000178679 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm35619-201ENSMUST00000222548 600 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Kat6b-203ENSMUST00000112458 997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr97-206ENSMUST00000216225 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Arhgef9-202ENSMUST00000113876 5342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Tnik-201ENSMUST00000159236 12276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm15502-201ENSMUST00000121449 208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 U90926-202ENSMUST00000201332 524 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NischQ80TM9 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms