Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm12365-201ENSMUST00000117931 568 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms