Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm15316-201ENSMUST00000121082 421 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12174-201ENSMUST00000119853 813 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1502-201ENSMUST00000074221 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trim71Q1PSW8 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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