Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Traf3ip1Q149C2 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Traf3ip1Q149C2 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms