Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm13006-201ENSMUST00000118683 214 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pde1bQ01065 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pde1bQ01065 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pde1bQ01065 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pde1bQ01065 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pde1bQ01065 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Pde1bQ01065 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Pde1bQ01065 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 n-R5s9-201ENSMUST00000104432 117 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Pde1bQ01065 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms