Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm43699-201ENSMUST00000201312 818 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Irx1P81068 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Irx1P81068 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Irx1P81068 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Ndnf-201ENSMUST00000054351 10101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Mir688-201ENSMUST00000102055 75 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Irx1P81068 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Irx1P81068 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Irx1P81068 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms