Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Tmcc3-202ENSMUST00000117460 3217 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Lamb3-201ENSMUST00000016315 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 B430306N03Rik-201ENSMUST00000049614 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprmP28828 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprmP28828 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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PtprmP28828 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PtprmP28828 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gpm6b-203ENSMUST00000112224 4644 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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PtprmP28828 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PtprmP28828 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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