Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gprasp1-202ENSMUST00000113145 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxrbP28704 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxrbP28704 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RxrbP28704 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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