Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RxraP28700 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RxraP28700 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm6490-201ENSMUST00000111862 461 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm6610-201ENSMUST00000186324 358 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RxraP28700 AC157650.2-201ENSMUST00000224666 328 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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