Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC122346.2-201ENSMUST00000224326 2931 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 3110043O21Rik-201ENSMUST00000084724 3413 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm14131-201ENSMUST00000119636 719 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr1388-201ENSMUST00000055584 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm9837-201ENSMUST00000057722 731 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ptprc-207ENSMUST00000183301 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm5535-208ENSMUST00000210482 1403 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Vmn1r193-203ENSMUST00000227562 6840 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd9P28357 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms