Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 D430020J02Rik-201ENSMUST00000220477 2941 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
P18529 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
P18529 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
P18529 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
P18529 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms