Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Ccl20O89093 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm11558-201ENSMUST00000118454 459 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Hax1-204ENSMUST00000197725 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
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Ccl20O89093 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccl20O89093 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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