Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm5538W4VSP6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gm5538W4VSP6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Gm5538W4VSP6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Gm5538W4VSP6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Gm5538W4VSP6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm5538W4VSP6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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