Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm28036V9GXJ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm28036V9GXJ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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