Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Homer1Q9Z2Y3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms