Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt85Q9Z2T6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt85Q9Z2T6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms