Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mbd3Q9Z2D8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms