Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cldn8Q9Z260 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn8Q9Z260 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms