Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccne2Q9Z238 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccne2Q9Z238 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms