Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Trip6Q9Z1Y4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trip6Q9Z1Y4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms