Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Ilf3Q9Z1X4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ilf3Q9Z1X4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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