Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ap3b1Q9Z1T1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ap3b1Q9Z1T1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms