Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sfrp4Q9Z1N6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp4Q9Z1N6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms