Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nek4Q9Z1J2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms