Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Znf394Q9Z1D9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf394Q9Z1D9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms