Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shcbp1Q9Z179 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shcbp1Q9Z179 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms