Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne6Q9Z140 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms